Несмотря на то, что вопрос вентиляции формикария не очень хорошо изучен, все киперы склоняются к тому, что она необходима.
В природных муравейниках вентиляция осуществляется за счет сложных процессов аэрации почвы и разложения органики внутри муравейника.

Необходимость вентиляции появляется с того момента, как матка посажена в инкубатор. Для вентиляции в инкубаторе достаточно того, что вата на входе пропускает воздух. Однако нужно соблюдать кое-какие правила:

• Никогда не закрывайте вход в инкубатор не проводящим воздух материалом. Например, имели место прецеденты, когда вход затыкали поршнем шприца. Это может привести к тому, что семья просто задохнется.
• Вату, закрывающую вход необходимо скатывать не плотно, (лишь до того состояния, чтоб муравьи не могли ее вытолкнуть), чем лучше она будет пропускать воздух, тем лучше.
• При соединении инкубатора с ареной площадь вентиляции падает на диаметр соеденительной трубки. Поэтому крайне желательно сделать вентиляционные отверстия в крышке арены, чтоб компенсировать эту потерю.

Существует два самых распростаненных способа изготовления вентиляционных отверстий:

• Прожигание горячей иглой множества точечных отверстий (естественно подходит только для пластика). Этот вариант как правило менее эстетичен.
• Сверление отверстия нужного диаметра, и заклеивание его металлической сеткой.

Необходимо подбирать сетку так, чтоб размер ячеек соответствовал размеру ваших муравьев, и они не могли пролезть сквозь нее. Сетка крепится к формикарию либо на аквариумный герметик, либо с помощью резиновых уплотнений.
Основные направления поиска сетки:

• Магазины сантехники. Сетки из рассеивателей для смесителей, либо сетки из фильтров для воды.
• Магазины «все для курения». Сетки для трубок.
• Магазины товаров для сада. Сетки для полива.
• Магазины кухонной утвари. Сита, ситечки.
• Строительные магазины, рынки. Тут можно найти мелкую металлическую сетку в рулонах.